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关键词： 刚地弓形虫   核糖体蛋白L35A   结构   功能   生物信息学  

摘要： 目的:克隆刚地弓形虫核糖体蛋白L35A基因,并运用生物信息学方法分析和预测RPL35A蛋白的结构与功能。方法:利用PCR技术扩增刚地弓形虫RPL 35 A基因,并通过ProtParam、ProtScale、TMpred和Signa IP预测RPL35A蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区和信号肽等一级结构,通过MEGA 6.0和DANSTAR软件分析RPL35A蛋白的保守性。用NPSA SOPMA和Swiss-Model预测RPL35A蛋白的二级和三级结构。并通过PSORT、CD-Search、DUT和IEDB数据库预测RPL35A蛋白的亚细胞定位、结构域、翻译后修饰位点和抗原表位等。结果:刚地弓形虫RPL 35 A基因片段大小为339 bp,编码112个氨基酸,蛋白质分子式为C 579 H 940 N 176 O 151 S 2,相对分子质量为12847.04,理论等电点为10.94,无跨膜区和信号肽,为亲水性不稳定蛋白,在不同虫株间高度保守。二级结构主要有无规则卷曲和延伸链。RPL35A蛋白亚细胞定位于线粒体,有9个磷酸化位点、12个O-糖基化位点和6个潜在的B细胞抗原表位。结论:刚地弓形虫RPL35A蛋白具有潜在的免疫原性,可作为刚地弓形虫疫苗和药物靶点研究的候选分子。

关键词： 山西省   黄河流域   林业有害生物防治  

摘要： 山西省黄河流域是国家重要生态保护工程的组成部分。在对山西省林业有害生物防治现状和成因进行分析的基础上,提出了林业有害生物防控对策和措施。

关键词： 分层抽样   站位优化   采样设计   生物多样性   茂名海域  

摘要： 渔业资源调查对于渔业资源评估和管理至关重要,也对生物多样性的保护具有重要影响。然而,在海洋中进行以生物多样性评估为目标的渔业资源调查成本高,且受到现场条件制约。因此,周密的采样站点设计是确保数据质量和调查效益最大化的关键。增加采样站点数量可以提高生物多样性数据的准确性,但也增加了调查成本,并可能对海洋环境和生态系统造成负面影响。因此,采样设计需要在样本量和准确性之间取得平衡,以满足预定目标和预算。本研究以广东省茂名海域为例,采用了R语言数据包SamplingStrata中提供的可在多变量情境下通过分层抽样进而优化采样设计的方法,通过综合考虑分层和样本分配优化,评估了渔业生物多样性调查所需最佳站位数量。结果表明,通过分层抽样和适当的样本分配,可以在保证生物多样性数据精确度的同时降低采样站点数量,减少对海洋生态系统的不利影响。在茂名海域调查中,将最大变异数等于0.05作为数据精确度要求以及水深作为分层变量更适宜,春季、秋季以及不区分季节采样站点数量分别取12、14和21为宜。本研究优化了茂名海域以渔业生物多样性评估为目标的渔业资源调查站位设计,提供了一种有效的站位优化方法,并可为后期渔业资源调查站位设计提供参考。

关键词： 设施土壤   团聚体   鸡粪   碳循环   微生物功能预测  

摘要： 【目的】为完善细菌和真菌在微域环境下的碳代谢功能特征,提升设施潮土肥力。【方法】利用Illumina扩增子高通量测序技术,通过PICRUSt2软件联合KEGG数据库和FUNGuild数据库平台,分别对不同处理土壤团聚体中细菌和真菌的碳代谢功能进行预测分析。【结果】施用有机肥后,土壤团聚体的平均质量直径和几何均重直径分别提高了28%和17%;各级别团聚体中土壤有机碳(SOC)富集系数均大于1,10~7 mm、5~3 mm和2~0.5 mm级别团聚体中溶解性有机碳(DOC)富集系数小于1,而其他级别团聚体DOC富集系数均大于1;10~7 mm级别团聚体对SOC和DOC的贡献率最高,施用有机肥后分别由37.3%和36.8%提高至53.2%和47.6%,7~5 mm级别团聚体对SOC和DOC的贡献率也显著高于未施肥土壤(P<0.05);施用鸡粪有机肥后,原状土中的细菌碳代谢基因amyA、cdaR、cdhE和glxK的相对丰度显著升高了6.4%~19.5%,其中,amyA基因的相对丰度在10~7 mm、7~5 mm和0.5~0.25 mm级别的团聚体中分别显著升高了65.8%、37.1%和57.0%;cdaR基因在10~7 mm级别团聚体中的相对丰度显著升高了16.7%;cdhE基因的相对丰度在3~2 mm和0.5~0.25 mm级别的团聚体中分别显著升高了58.0%和117.8%。对真菌而言,施用鸡粪有机肥使腐生-共生营养型真菌在0.5~0.25 mm和<0.25 mm级别团聚体中的占比显著升高(P<0.05),其中,内生-垃圾腐生-土壤腐生-未定义腐生真菌相对丰度分别升高46.9%和73.3%,且这类真菌在0.5~0.25 mm和<0.25 mm级别团聚体中的相对丰度显著高于其他级别团聚体。【结论】长期施用鸡粪有机肥提高了团聚体的稳定性,促进有机碳在各级别团聚体中的积累,使SOC和DOC主要固持在宏团聚体中,同时也促进DOC从较大级别团聚体向较小级别团聚体的迁移。0.5~0.25 mm和<0.25 mm级别团聚体上细菌和真菌碳代谢功能显著异于其他级别团聚体,施用有机肥通过提高较大级别团聚体中参与不稳定碳降解的基因影响细菌的碳代谢功能,而通过提高较小级别团聚体中腐生-共生营养型真菌从而影响真菌对难降解碳的代谢功能。

关键词： 椎间盘退变   氧化应激   差异分析   WGCNA分析   LASSO回归   SVM-RFE分析   随机森林   特征基因   生物信息学   免疫浸润分析  

摘要： 背景:氧化应激与椎间盘退变的发生发展息息相关,但其发病机制和有效治疗方法仍不明确。目的:运用生物信息学及3种机器学习算法识别与椎间盘退变伴氧化应激相关的关键基因及免疫浸润分析,并进行实验验证。方法:从GEO数据库获得椎间盘退变基因表达谱以及从GeneCards数据库获得氧化应激相关基因,对椎间盘退变数据集进行差异分析及加权基因共表达网络(WGCNA)分析,两者取交集并与氧化应激相关基因取交集得到候选hub基因,对候选hub基因进行GO和KEGG分析;运用机器学习(LASSO回归、SVM-RFE及随机森林)筛选最佳特征基因并进行受试者特征曲线验证,同时行相关免疫浸润分析。收集2023年7-11月就诊于山西医科大学第二医院的颈椎病患者的椎间盘样本作为椎间盘退变组,颈椎脊髓损伤患者的椎间盘样本作为对照组,采用qPCR方法验证特征基因在椎间盘退变组织中的相对表达量。结果与结论:(1)经过差异基因分析获取424个差异表达基因,WGCNA分析得到5087个基因,同时获得氧化应激基因1399个,进而得到23个候选hub基因;(2)GO分析结果显示,主要参与细菌防御反应、细菌来源分子反应等生物过程;涉及分泌颗粒腔、细胞质囊泡腔等细胞组成;涉及内肽酶活性和硫化合物结合等分子功能;(3)KEGG分析结果显示,候选hub基因与中性粒细胞胞外诱捕网形成、肾素-血管紧张素系统通路等信号通路有关;(4)运用3种机器学习和ROC验证后得到关键基因HSPA6和PKD1;(5)免疫浸润分析显示HSPA6与活化树突状细胞(r=0.88,P<0.001)、活化CD4^(+)T细胞(r=-0.72,P<0.01)等密切相关,同时PKD1与效应型记忆CD8^(+)T细胞(r=0.55,P<0.05)、活化树突状细胞(r=-0.56,P<0.05)等密切相关;(6)q PCR实验结果表明椎间盘退变组中HSPA6基因低于对照组(P<0.0001),而PKD1基因高于对照组(P<0.0001);(7)结果表明运用生物信息学及机器学习算法证实HSPA6和PKD1可作为椎间盘退变伴氧化应激的生物标志物,可能通过干预HSPA6和PKD1来改善椎间盘退变。

关键词： 正畸牙移动   复发   生物医学药物   中成药  

摘要： 正畸术后复发是口腔正畸学研究热点之一。目前观点认为由于正畸牙移动和正畸牙复发期间发生的生理模式具有相似性,所以通过靶向参与牙槽骨改建的降低正畸牙移动速率的生物化学制剂可以潜在地调节正畸牙复发。通过局部给药和全身给药干预正畸复发的相关研究药物目前主要处于体外实验研究阶段。在动物实验中观察到一些生物药物具有其无创、不良反应小、干预方便等特点,成为近年来应用于干预正畸复发相关研究的重要方向。本文针对补骨脂、植物雌激素依普黄酮、乳铁蛋白、雌激素受体调节剂雷洛昔芬这4类生物药物的相关成骨机制及其在正畸术后复发领域的基础研究进行综述。

关键词： 连续并购   并购动因   华熙生物  

摘要： 随着国民生活水平的提升,居民对于医疗美容方面的需求日渐增加,许多生物制造企业趁着行业红利时期快速发展起来,并试图通过并购增强企业的竞争力。华熙生物在2017~2022年基于资源整合、增强竞争力以及拓展新业务等原因,先后并购法国REVITACARE(润为他)、东营佛思特以及益而康生物。本文对华熙生物的并购过程进行分析,探究其并购动因,对探究其他生物制造企业的并购动因有一定的参考意义。

关键词： 海洋生物资源   水产资源开发   海洋经济   海洋生态环境  

摘要： 山东是海洋大省,海洋生物资源的开发与利用对山东海洋经济的可持续发展意义重大。2013~2022年,山东海洋生物结构发生较大的变化,新技术、新工艺也促进了海洋生物资源的开发与利用。本文综合分析了2013~2022年山东省海洋植物资源、海洋鱼类资源、海洋甲壳动物资源、海洋贝类生物资源、海洋头足类生物资源等大宗海洋生物资源的变化及其原因,并介绍了这些资源的开发利用情况。研究结果表明山东大宗海洋生物的捕捞产量总体呈下降趋势,多数品种的养殖产量呈上升趋势,海洋生物资源的总量在上升。

关键词： 叶面喷施   微生物制剂   油松幼苗   土壤养分  

摘要： 分析叶面喷施不同剂量微生物制剂对油松幼苗生长,在山东省某油松林地开展试验,依据BGB微生物菌剂的剂量分为四个处理,CK(不做任何处理)A1(10g/株)A2(30g/株)A3(50g/株),观察不同量的微生物制剂对油松幼苗生长以及土壤养分的影响。结果证实,不同剂量微生物制剂均对油松幼苗生长产生影响。各处理的苗高、地径和冠幅从大到小排序是A3>A2>A1>CK(P<0.05)整体而言,A3处理的油松幼苗长势最好;不同剂量微生物制剂不同时期的幼苗成活率均高于CK组,随着微生物制剂剂量的增加,其成活率逐渐增高,呈正相关趋势。净光合速率、气孔导度、蒸腾速率对比,从大到小依次是A3>A2>A1>CK,整体而言,A3处理优势明显;A3处理的有机质、碱解氮、速效磷均高于其他处理(P<0.05),A3速效钾极显著高于CK组(P<0.01),显著高于A1组和A2组(P<0.05),呈A3>A2>A1>CK的趋势。由此可知,叶面喷施微生物制剂也促进油松幼苗的生长,改善土壤养分,以50g/株的剂量最佳。

关键词： 玉米   非生物胁迫   基因组学   转录组学   蛋白质组学   代谢组学  

摘要： 玉米(Zea mays L.)是重要的粮饲兼用作物,但其产量和品质经常受到各种非生物胁迫的影响。随着分子生物学的发展,组学技术现在已经成为研究植物在逆境中对分子机制响应的一种重要手段。为系统、全面地解析玉米对非生物胁迫响应的总体机制,选育出高产、多抗、广适性强的玉米新品种,本研究从基因组学、转录组学、代谢组学、蛋白质组学方面,对近十年来玉米对温度、干旱、光照等非生物胁迫响应的组学研究进展进行了综述。建议今后将多组学技术相关联,系统、全面地分析玉米对非生物胁迫响应的总体机制;同时,大力发展更加有效的生物信息学分析技术,加深对玉米响应和适应联合胁迫的认识。